Broyler kesim aşamalarından farklı örnekleme metotları ile alınan karkaslarda Salmonella spp., Salmonella Enteritidis ve Salmonella Typhimurium prevalansının ISO 6579-1:2017 ve real-time PCR ile belirlenmesi

dc.contributor.advisorTemelli, Seran
dc.contributor.authorCoşkun, Ahmet Gökhan
dc.contributor.departmentSağlık Bilimleri Enstitüsü
dc.contributor.departmentVeterinerlik Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
dc.contributor.orcid0000-0002-5181-7577
dc.date.accessioned2024-09-30T11:11:02Z
dc.date.available2024-09-30T11:11:02Z
dc.date.issued2024-04-18
dc.description.abstractÇalışmada, broyler kesimhanesinde farklı örnekleme metotları ile çeşitli örnekleme yerlerinden alınan karkas örneklerinde, Salmonella spp., S. Enteritidis ve S. Typhimurium varlığının belirlenmesi ve örnekleme metotlarının etkinliğinin karşılaştırılması amaçlandı. Ağustos 2021-Ocak 2022 arasında, Bursa’da bir kanatlı işletmesinde boyun derisi eksizyonu, bütün karkas yıkama ve surfaktan ilave edilmiş bütün karkas yıkama metotları kullanılarak kesimin farklı kontaminasyon düzeylerindeki tüy yolumu sonrası, iç organ çıkartma sonrası ve soğutma sonrası aşamalarından örneklemeyapıldı. Her bir örnekleme yerinden 14 birim, her bir örnekleme metodundan 42 birim olmak üzere toplam 126 birim örnek alındı. Salmonella spp. varlığının belirlenmesi için EN/ISO 6579-1:2017 metodu uygulanırken, elde edilen izolatların doğrulanmasında Salmonella spesifik real-time PCR (Salm-rPCR) analizi uygulandı. Salmonellaların serotiplendirilmesi, EN/ISO 6579-3:2014 metoduna göre yapıldı. Ayrıca S. Enteritidis ve S. Typhimurium varlığının belirlenmesi amacıyla, bu serovarlara spesifik rPCR (SE/ST-rPCR) analizi uygulandı. Örneklerin %83,33 (105/126)’ünün Salmonella spp. taşıdığı belirlendi ve tüm izolatlar Salm-rPCR analizi ile doğrulandı. Salmonella’nın tespiti yönünden etkinliği karşılaştırılan örnekleme metotları arasında istatistiksel olarak önemli bir farkın olmadığı, örnekleme yerleri arasındaki farkın ise önemli (p<0,05) bulunduğu saptandı. Serotiplendirme ile izolatların hiçbirinin S. Enteritidis ve S. Typhimurium olmadığı, yapılan SE/ST-rPCR analizi ile doğrulandı. En yaygın serovarın Virchow (%82,86) olduğu bunu Schwarzengrund (%14,29) ve Bredeney (%0,95) serovarlarının izlediği tespit edildi. Broyler kesim aşamalarındaki Salmonella spp. ve serovarlarının EN/ISO’nun ilgili güncel standartları kullanılarak belirlenmesinin ilk kez örnekleme metotlarının karşılaştırılması ile birlikte yapıldığı bu çalışma, literatüre ve kanatlı sektörüne güncel ve orijinal veri katkısı sağladı. Ayrıca, broylerlerin SE/ST’den farklı olarak, Virchow ve Schwarzengrund patojen Salmonella serovarlarının asemptomatik taşıyıcısı olduğu belirlendi.
dc.description.abstractThis study aimed to determine the presence of Salmonella spp., S. Enteritidis and S. Typhimurium, and the effectiveness of sampling methods in carcasses collectedfrom various sampling stages by different sampling methods at a broiler slaughterhouse. Between August 2021 and January 2022, sampling was performed at a poultryprocessing plant in Bursa, using neck skin excision, whole carcass rinse, andsurfactant-added whole carcass rinse methods from post-defeathering, post-evisceration and post-chill stages of slaughter of different contamination levels. A totalof 126 units of sample, comprised of 14 from each sampling stage, and 42 by each sampling method. EN/ISO 6579-1:2017 method was applied to determine the presenceof Salmonella spp., where isolate confirmation was done by Salmonella specific real-time PCR (Salm-rPCR) analysis. Serotyping of Salmonella was implemented according to EN/ISO 6579-3:2014 method. Additionally, S. Enteritidis and S. Typhimurium specific rPCR (SE/ST-rPCR) analysis was carried out to determine thepresence of these serovars.Salmonella spp. was detected in 83.33% (105/126) of the samples, where allisolates were confirmed by Salm-rPCR analysis. No statistically meaningful differencewas determined between the sampling methods compared, in terms of theireffectiveness for detecting Salmonella, while the difference between the samplingstages was significant (p <0.05). Absence of S. Enteritidis and S. Typhimurium,determined by serotyping, was confirmed by SE/ST-rPCR analysis. The most commonserovar was Virchow (82.86%), followed by Schwarzengrund (14.29%), and Bredeney (0.95%). This initial study, where determination of Salmonella spp. and its serovars atbroiler slaughter stages by relevant and current EN/ISO standards, coupled withcomparison of different sampling methods, contributed up-to-date and original data toliterature and the poultry industry. Additionally, other than SE/ST, broilers were determined as asymptomatic carriers of Virchow and Schwarzengrund pathogenic Salmonella serovars.
dc.format.extentIX, 144 sayfa
dc.identifier.urihttps://hdl.handle.net/11452/45503
dc.language.isotr
dc.publisherBursa Uludağ Üniversitesitr_TR
dc.relation.bapHDP(V)-2020/4
dc.relation.bapTGA-2021-398
dc.relation.publicationcategoryTeztr_TR
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/openAccessen_US
dc.subjectBroyler
dc.subjectGıda güvenliği
dc.subjectÖrnekleme
dc.subjectSalmonella
dc.subjectSerovar
dc.subjectBroiler
dc.subjectFood security
dc.subjectSampling
dc.titleBroyler kesim aşamalarından farklı örnekleme metotları ile alınan karkaslarda Salmonella spp., Salmonella Enteritidis ve Salmonella Typhimurium prevalansının ISO 6579-1:2017 ve real-time PCR ile belirlenmesi
dc.title.alternativeDetermination of Salmonella spp., Salmonella Enteritidis and Salmonella Typhimurium prevalence by ISO 6579-1:2017 and real-time PCR in carcasses collected from broiler slaughtering stages by different sampling methodsen
dc.typedoctoralThesisen_US
local.contributor.departmentSağlık Bilimleri Enstitüsü/Veterinerlik Besin Hijyeni ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı

Files

Original bundle

Now showing 1 - 1 of 1
Loading...
Thumbnail Image
Name:
Ahmet_Gokhan_Coskun.pdf
Size:
3.66 MB
Format:
Adobe Portable Document Format